Skip to content

Ekspresja mikroRNA w cytogenetycznie normalnej ostrej białaczce szpikowej ad 5

2 weeks ago

356 words

Wartość sumaryczna mikroRNA w grupie walidacyjnej była odwrotnie proporcjonalna do odsetka krążących blastów (P = 0,004) i była dodatnio związana z ekspresją ERG (P = 0,04) (Tabela 2 Dodatku Uzupełniającego). Wartość podsumowania mikroRNA była również odwrotnie proporcjonalna do przeżycia wolnego od zdarzeń (P = 0,03). Aby wyświetlić zależność między wartością sumaryczną mikroRNA a wynikiem klinicznym, grupę walidacyjną podzielono na medianę wartości sumy mikroRNA (rysunek 2). Szacowany 5-letni wskaźnik przeżycia wolnego od zdarzeń wynosił 36% dla pacjentów z wartościami podsumowania dla mikroRNA powyżej mediany i 11% dla pacjentów z wartościami poniżej mediany. W modelu wielowymiarowym wartość sumaryczna mikroRNA jako zmiennej ciągłej była powiązana z przeżyciem wolnym od zdarzeń (P = 0,04), nawet po dostosowaniu do stosunku allelicznego FLT3-ITD do FLT3 typu dzikiego (P = 0,02) i do liczba białych komórek (P = 0,04) (tabela 3). W odniesieniu do innych markerów molekularnych ekspresja BAALC i mutacje NPM1 nie spełniały kryteriów statystycznych dla włączenia do modeli wielu zmiennych, a liczba pacjentów z dostępnymi danymi dotyczącymi ekspresji ERG była zbyt mała, aby wyciągnąć wnioski na temat interakcji między wartościami sumarycznymi mikroRNA i Poziomy ekspresji ERG.
Korelacja z ekspresją genów
Z 12 sond microRNA w sygnaturze grupy treningowej 5 reprezentowało członków rodziny microRNA-181. Ta rodzina ulega ekspresji na stosunkowo niskim poziomie w niezróżnicowanych hematopoetycznych komórkach prekursorowych22, a ekspresja mikroRNA 181a jest związana z AML.13. Wśród innych mikroRNA w sygnaturze mikroRNA 124, 128 i 219 były związane z różnicowaniem neuronów, 23, 24 mając na uwadze, że ostateczne cele lub funkcje dla mikroRNA 194, 220 i 320 są nieznane.
Na podstawie zasady, że mikroRNA regulują ekspresję genów, badaliśmy, czy sumaryczna wartość mikroRNA była skorelowana z ekspresją genów ocenianych w mikromacierzy Affymetrix. W szczególności szukaliśmy związku między ekspresją członków mikroRNA sygnatury wyników i ekspresji genów w AML (patrz Dodatek dodatkowy). Zawarliśmy w tej analizie 38 pacjentów w grupie walidacyjnej, dla której profile ekspresji genów mikromacierzy były dostępne w naszej bazie danych5 (rysunek 1B). Stwierdziliśmy, że poziomy ekspresji 452 genów korelowały istotnie z wartością sumaryczną mikroRNA (P <0,001) (Tabela 3 Dodatku Uzupełniającego).
Podwyższone wartości sumaryczne mikroRNA były związane ze zwiększoną ekspresją genów zaangażowanych w mechanizmy odporności wrodzonej, w tym genów kodujących receptory Toll-podobne (TLR2, TLR4 i TLR8) 25 i genów kodujących interleukinę-1. (IL1.) i wyższych efektorów, które kontrolują aktywacja tej cytokiny, w tym członek rodziny 8 (CARD8), CARD12 (NLRC4), CARD15 (NOD2), domena pirydynowa i CARD (ASC lub PYCARD) i kaspaza (CASP1) 26 (patrz rekrutacja domeny domeny Kpp) (patrz Tabela 3 Dodatku Uzupełniającego).
Aby ocenić stosunek wartości sumarycznych mikroRNA i ekspresji genów w inny sposób, wykorzystaliśmy informacje z projektu Gene Ontology, aby przetestować, który z terminów był nadreprezentowany w sygnaturze ekspresji genu mikromacierzy, która korelowała z wartością sumy mikroRNA
[patrz też: USG genetyczne, endometrioza stopnie, leczenie pod mikroskopem ]

Powiązane tematy z artykułem: endometrioza stopnie leczenie pod mikroskopem USG genetyczne