Skip to content

Ekspresja mikroRNA w cytogenetycznie normalnej ostrej białaczce szpikowej ad 6

1 month ago

486 words

Zdefiniowaliśmy nadreprezentowane pojęcie jako takie, dla którego więcej członków przypisanych do tego terminu znaleziono w sygnaturze genu mikromacierzy, niż oczekiwano przez przypadek. Znaleźliśmy 83 nadreprezentowanych terminów. Wystąpiło co najmniej 50% reprezentacji w sygnaturze ekspresji genu mikromacierzy dla 16 z 83 terminów. Spośród tych 16 terminów, 15 obejmowało członków, którzy uczestniczą w mechanizmach wrodzonej odporności kontrolowanej przez receptory Toll-podobne i receptory wiążące nukleotydy (podobne do NOD). Te ostatnie receptory kontrolują aktywację interleukiny-1., cytokiny, która bierze udział w promowaniu autonomicznego wzrostu blastów AML, oprócz jej roli prozapalnej 26-29 (Tabela 4 Dodatku Uzupełniającego). Ponieważ mikroRNA hamują ekspresję specyficznych genów bezpośrednio, poprzez obniżającą modulację ekspresję kodowanego białka lub pośrednio, kontrolując ekspresję innych czynników transkrypcyjnych lub białek regulatorowych, przeszukaliśmy również bazę danych Targetscan Release 4.1 (www.targetscan.org ) w celu oszacowania, który z 452 genów w sygnaturze ekspresji genu mikromacierzy został przewidziany jako bezpośredni cel mikroRNA tworzących sygnaturę. Spośród tych 452 genów 32 – w tym TLR4, CARD8, CASP1, IL1B, rodzina substancji czynnej 11 element (SLC11A1), receptor zmiatający makrofagi (MSR1) i fragment Fc receptora IgA o wysokim powinowactwie IgG (CD64) (FCGR1A) – zostały przewidziane cele członków rodziny microRNA-181, która jest najbardziej reprezentowaną rodziną mikroRNA w sygnaturze wyniku. Poziomy ekspresji tych 32 genów były odwrotnie skorelowane z poziomami ekspresji członków rodziny microRNA-181, przy współczynniku korelacji Pearsona w zakresie od -0,84 do -0,45 dla sond (ryc. 2 Dodatkowego dodatku).
Dyskusja
Zmienioną ekspresję mikroRNA obserwowano w kilku rodzajach raka, 10-12, ale niewiele wiadomo na temat ekspresji mikroRNA w AML. W tym badaniu podajemy sygnaturę mikroRNA, która jest powiązana z wynikiem klinicznym w podgrupie pacjentów z wysoce ryzykownymi cechami molekularnymi AML (tych, którzy mają FLT3-ITD, NPM1 typu dzikiego lub oba). Ta podgrupa stanowi około 65% pacjentów z prawidłową cytogenetycznie AML i jedną trzecią wszystkich pacjentów z AML, którzy są w wieku poniżej 60 lat. Odkryliśmy również związek między sygnaturą mikroRNA i ekspresją genów zaangażowanych w odporność wrodzoną w AML.
Sygnatura microRNA została uzyskana od grupy treningowej pacjentów i składała się z 12 sond, które miały istotny związek z wynikiem klinicznym. Podpis został zatwierdzony w grupie pacjentów, którzy otrzymali podobne leczenie w innym protokole niż ten stosowany w przypadku pacjentów w grupie szkoleniowej. Obliczając dla każdego pacjenta sumaryczną wartość poziomów ekspresji mikroRNA, wykazaliśmy, że ciągła wartość podsumowania mikroRNA była związana z przeżyciem bez zdarzeń. Takie podejście wyeliminowało potrzebę wyboru wartości odcięcia mikroRNA, która arbitralnie definiowała grupy pacjentów dla porównania. Co więcej, sygnatura mikroRNA okazała się niezależna od związku między FLT3-ITD a wynikiem, ponieważ jego związek z przeżyciem bez zdarzeń w modelu wielowymiarowym z korektą dla FLT3-ITD pozostawał znaczący.
Kilka ograniczeń naszego badania zasługuje na uwagę
[podobne: cialis apteka internetowa, trigeminia komorowa, poradnia chirurgii naczyniowej ]

Powiązane tematy z artykułem: cialis apteka internetowa poradnia chirurgii naczyniowej trigeminia komorowa